林承棋 教授

  教育和工作簡(jiǎn)歷

   1998至2003年，東南大學(xué)，臨床醫(yī)學(xué)，學(xué)士 
   2003至2006年，東南大學(xué)，遺傳學(xué)，碩士 
   2006至2008年，新加坡國(guó)立大學(xué)，研究助理 
   2008至2013年，Stowers Institute for Medical Research，分子與細(xì)胞生物學(xué)，博士
   2013至今，東南大學(xué)，生命科學(xué)院研究院，教授 

研究方向：轉(zhuǎn)錄調(diào)控在發(fā)育及疾病發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)理

多能胚胎干細(xì)胞（pluripotent embryonic stem Cells）因其自我更新（self-renewal）及全能分化的潛力，成為再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域治療退行性疾病的基礎(chǔ)。如何高效安全特異地分化胚胎干細(xì)胞成特殊的成熟細(xì)胞是當(dāng)今的主要研究熱點(diǎn)之一，也是制約其臨床應(yīng)用的主要瓶頸之一。本實(shí)驗(yàn)室主要集中在轉(zhuǎn)錄延伸調(diào)控以及增強(qiáng)子表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域來(lái)探索胚胎干細(xì)胞維持其自我更新以及多向分化潛能的分子機(jī)理，以及轉(zhuǎn)錄延伸調(diào)控因子以及增強(qiáng)子突變?cè)诩膊“l(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)理。

1. 超級(jí)延伸復(fù)合物（SEC）在發(fā)育及疾病發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)理；

超級(jí)延伸復(fù)合物Super Elongation Complex (SEC) 調(diào)控著基因的快速協(xié)調(diào)性表達(dá)，在胚胎干細(xì)胞定向分化中發(fā)揮著重要作用。SEC的異常激活是引起嬰幼兒白血病、HIV以及CHOP syndrome的主要原因之一。除了SEC，SEC類似復(fù)合物SEC

L2和－L3也在發(fā)育及疾病的發(fā)生發(fā)展中起到非常重要的作用。本課題將運(yùn)用生化學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、基因組學(xué)以及表觀遺傳學(xué)手段探尋SEC及SEC

L如何差異性地調(diào)控胚胎干細(xì)胞分化，以及它們?cè)诩膊≈械奶禺愋宰饔谩?/span>

2. SEC相關(guān)增強(qiáng)子結(jié)合因子在維持胚胎干細(xì)胞自我更新以及多向分化潛能的分子機(jī)理；

增強(qiáng)子(enhancer)是指一段可以通過(guò)與激活蛋白的結(jié)合增強(qiáng)其連鎖基因轉(zhuǎn)錄水平的DNA序列，其對(duì)于發(fā)育相關(guān)基因的時(shí)空特異性表達(dá)起到了關(guān)鍵性的作用。近年來(lái)，增強(qiáng)子表觀遺傳學(xué)研究表明在胚胎發(fā)育早期階段存在多種不同狀態(tài)的增強(qiáng)子來(lái)維持其多向分化潛能。目前對(duì)于處于暫停或失活狀態(tài)的增強(qiáng)子的功能尚不清楚。本課題將運(yùn)用生化學(xué)、遺傳學(xué)以及基因組學(xué)手段探尋ELL3相關(guān)pioneer factors如何通過(guò)調(diào)控增強(qiáng)子活性和染色質(zhì)可塑性來(lái)維持胚胎干細(xì)胞自我更新和多向分化潛能的分子機(jī)理。

近期代表性論文：

1. Luo Z, Gao X, Lin C, Smith ER, Marshall SA, Swanson SK, Florens L, Washburn MP, Shilatifard A. Zic2 is an enhancer-binding factor required for embryonic stem cell specification. Mol Cell. 2015 Feb 19;57(4):685-94.

2. Lin C, Garrus AS, Luo Z, Guo F, Shilatifard A. The RNA Pol II elongation factor Ell3 marks enhancers in ES cells and primes future gene activation. Cell. 2013 Jan 17;152(1-2):144-56.

3. Luo Z, Lin C, Shilatifard A. The super elongation complex (SEC) family in transcriptional control. Nat Rev Mol Cell Biol. 2012 Aug 16;13(9):543-7.

4. Luo Z, Lin C, Guest E, Garrett AS, Mohaghegh N, Swanson S, Marshall S, Florens L, Washburn MP, Shilatifard A. The super elongation complex family of RNA polymerase II elongation factors: gene target specificity and transcriptional output. Mol Cell Biol. 2012 Jul;32(13):2608-17.

5. Lin C, Garrett AS, De Kumar B, Smith ER, Gogol M, Seidel C, Krumlauf R, Shilatifard A. Dynamic transcriptional events in embryonic stem cells mediated by the super elongation complex (SEC). Genes Dev. 2011 Jul 15;25(14):1486-98.

6. Mohan M, Lin C, Guest E, Shilatifard A. Licensed to elongate: a molecular mechanism for MLL-based leukaemogenesis. Nat Rev Cancer. 2010 Oct;10(10):721-8.

7. Lin C, Smith ER, Takahashi H, Lai KC, Martin-Brown S, Florens L, Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC, Shilatifard A. AFF4, a component of the ELL/P-TEFb elongation complex and a shared subunit of MLL chimeras, can link transcription elongation to leukemia. Mol Cell. 2010 Feb 12;37(3):429-37. (Recommended by the Faculty of 1000)

8. Wang P, Lin C, Smith ER, Guo H, Sanderson BW, Wu M, Gogol M, Alexander T, Seidel C, Wiedemann LM, Ge K, Krumlauf R, Shilatifard A. Global analysis of H3K4 methylation defines MLL family member targets and points to a role for MLL1-mediated H3K4 methylation in the regulation of transcriptional initiation by RNA polymerase II. Mol Cell Biol. 2009 Nov;29(22):6074-85