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PNAS | 高山教授團(tuán)隊(duì)在N6-甲基腺苷對(duì)HRAS的表觀轉(zhuǎn)錄調(diào)控驅(qū)動(dòng)腫瘤研究取得進(jìn)展

發(fā)布者:吳志龍發(fā)布時(shí)間:2023-03-31瀏覽次數(shù):1090

Ras家族蛋白(K-Ras、N-RasH-Ras)屬于小GTP酶蛋白家族成員,是第一個(gè)在人類腫瘤中被鑒定出來的致癌基因,其由KRAS、NRASHRAS基因所編碼。Ras蛋白主要定位于細(xì)胞膜內(nèi)側(cè),傳遞表皮生長(zhǎng)因子等胞外信號(hào)到細(xì)胞內(nèi),廣泛參與細(xì)胞的生長(zhǎng)、分化及腫瘤的發(fā)生與發(fā)展。其與GTP結(jié)合時(shí)為活化狀態(tài),而與GDP結(jié)合時(shí)則為非活化狀態(tài)。在大約三分之一的人類癌癥中,Ras的單個(gè)點(diǎn)突變(例如G12V、G13DQ61L)使其優(yōu)先與GTP結(jié)合而持續(xù)處于活化狀態(tài),導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生與發(fā)展。

過去幾十年,針對(duì)Ras的研究主要聚焦于其基因組突變、蛋白穩(wěn)定性調(diào)控,從而影響腫瘤的分子機(jī)制。然而,RAS基因在轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控仍不清楚。表觀轉(zhuǎn)錄組學(xué)是指轉(zhuǎn)錄后的RNA調(diào)控方式。其中之一就是堿基的轉(zhuǎn)錄后修飾,由特定的RNA修飾酶介導(dǎo),在基因表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮關(guān)鍵作用。m6A是真核生物RNA上最主要的轉(zhuǎn)錄后修飾,在生理過程中起著重要作用,其失調(diào)與包括癌癥在內(nèi)的各種疾病相關(guān),而RAS基因家族是否具有m6A修飾,以及m6A如何調(diào)控RAS基因的命運(yùn)仍然不清楚。

2023330日,東南大學(xué)和中大醫(yī)院雙聘高山教授團(tuán)隊(duì)在Proceedings of the National Academy of Sciences雜志在線發(fā)表題為Epitranscriptic Regulation of HRAS by N6-methyladenosine Drives Tumor Progression的研究論文。

 

該工作首先基于30例癌癥病人的meRIP測(cè)序數(shù)據(jù),構(gòu)建了較為全面的差異m6A修飾基因圖譜?;谠搱D譜,研究人員關(guān)注到HRAS基因在多種癌癥的癌組織比癌旁組織具有更高水平的m6A修飾,但在KRASNRAS基因上沒有觀察到明顯的m6A修飾。進(jìn)一步,研究人員鑒定到HRAS3’非編碼區(qū)存在3個(gè)m6A修飾位點(diǎn),并主要受去甲基化酶FTO調(diào)控,以及被YTHDF1蛋白閱讀從而提高H-Ras蛋白表達(dá),促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移。為了明確這3個(gè)m6A修飾位點(diǎn)的功能,研究人員使用dCas13b-FTOdCas13b-ALKBH5去甲基化系統(tǒng),特異性去除HRASm6A修飾后,發(fā)現(xiàn)H-Ras蛋白表達(dá)受到抑制,并降低了腫瘤細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移的能力(圖1)。最后,研究人員通過TCGA數(shù)據(jù)及組織芯片,發(fā)現(xiàn)在多種腫瘤中高表達(dá)HRAS與低表達(dá)FTO以及高表達(dá)YTHDF1具有顯著的相關(guān)性??偨Y(jié)來說,此項(xiàng)工作將HRAS的具體m6A修飾位點(diǎn)與腫瘤的發(fā)生發(fā)展聯(lián)系起來,為靶向Ras的治療提供新的理論基礎(chǔ)和策略。

東南大學(xué)生科院聯(lián)培博士后潘永柏和東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院的博士后顧殷敏為該論文的共同第一作者,高山教授為該論文的通訊作者。(生科院)